Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r39G3UWE6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms