Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Susd5G3UW60 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Susd5G3UW60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd5G3UW60 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd5G3UW60 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd5G3UW60 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms