Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LctF8VPT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LctF8VPT3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms