Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-M1F7CXU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M1F7CXU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms