Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8005F6YKY3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms