Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8220F6YKI2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8220F6YKI2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms