Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8247F6VRJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms