Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc74aE9Q9U8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms