Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp31E9Q6Y8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp31E9Q6Y8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms