Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Gcnt4E9Q649 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Gcnt4E9Q649 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Gcnt4E9Q649 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Gcnt4E9Q649 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Gcnt4E9Q649 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcnt4E9Q649 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Gcnt4E9Q649 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Gcnt4E9Q649 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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Gcnt4E9Q649 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcnt4E9Q649 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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