Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtproE9Q612 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms