Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdhb9E9Q5G2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhb9E9Q5G2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhb9E9Q5G2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms