Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip11E9Q512 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms