Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
8030474K03RikE9Q4Y8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
8030474K03RikE9Q4Y8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms