Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd1E9Q3H4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd1E9Q3H4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms