Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc171E9Q1U1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc171E9Q1U1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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