Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3250E9Q1M3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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