Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Zfp558E9Q1J0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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Zfp558E9Q1J0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zfp558E9Q1J0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Zfp558E9Q1J0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Zfp558E9Q1J0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Zfp558E9Q1J0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zfp558E9Q1J0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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