Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3893E9Q1I1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3893E9Q1I1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms