Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1B3

Gm7275, Predicted gene 7275, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7275E9Q1B3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm7275E9Q1B3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm7275E9Q1B3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms