Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdr1E9Q0B4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdr1E9Q0B4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cdr1E9Q0B4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms