Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gcom1E9PZ54 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gcom1E9PZ54 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms