Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54bE9PXC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms