Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rsf1E9PWW9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rsf1E9PWW9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rsf1E9PWW9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rsf1E9PWW9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rsf1E9PWW9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms