Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim30dE9PWL0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim30dE9PWL0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim30dE9PWL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms