Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
9530053A07RikE9PVG8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9530053A07RikE9PVG8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms