Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh8D3Z6W3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh8D3Z6W3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh8D3Z6W3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms