Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10110D3Z5M2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10110D3Z5M2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10110D3Z5M2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10110D3Z5M2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10110D3Z5M2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms