Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms