Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200bD3Z0P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem200bD3Z0P8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms