Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc8D3YZV8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc8D3YZV8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms