Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd1D3YXK1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samd1D3YXK1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 605 ms