Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BC048679D3YXE9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC048679D3YXE9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms