Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf11cB4XVP9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms