Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap58B2RW38 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap58B2RW38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap58B2RW38 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms