Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud7bB2RUR8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud7bB2RUR8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud7bB2RUR8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms