Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usf3B2RUQ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usf3B2RUQ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms