Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H60cB1B213 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H60cB1B213 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H60cB1B213 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms