Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpruB1AUH1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpruB1AUH1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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