Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp36B1AQJ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp36B1AQJ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms