Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rhox1B1APN4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhox1B1APN4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms