Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll11A4Q9F4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttll11A4Q9F4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms