Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrg1A2BFE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrg1A2BFE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrg1A2BFE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms