Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Patl2A2ARM1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Patl2A2ARM1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms