Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtcflA2APF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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