Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syndig1A2ANU3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms