Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SetxA2AKX3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SetxA2AKX3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SetxA2AKX3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms