Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FocadA2AKG8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FocadA2AKG8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FocadA2AKG8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FocadA2AKG8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms