Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VirmaA2AIV2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VirmaA2AIV2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms