Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brwd3A2AHJ4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Brwd3A2AHJ4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Brwd3A2AHJ4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brwd3A2AHJ4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms